Descifrar la información del genoma de la palma de aceite

  • Rajinder Singh Malaysian Palm Oil Board
  • Leslie Low Eng Ti Institusi, Bandar Baru Bangi
  • Maria Madon Institusi, Bandar Baru Bangi
  • Meilina Ong Abdullah Institusi, Bandar Baru Bangi
  • Leslie Ooi Cheng- Li Institusi, Bandar Baru Bangi
  • Chan Pek Lan Institusi, Bandar Baru Bangi
  • Ravigadev Sambanthamurthi Institusi, Bandar Baru Bangi
Palabras clave: Genoma, ADN, marcadores moleculares, marcadores de secuencias expresadas (SET), mejoramiento genético

Resumen

Un modesto comienzo para usar la tecnología genómica en la palma de aceite se realizó con la secuenciación de clones de ADN complementario (ADNC) como marcadores de secuencias expresadas (EST, por su sigla en inglés). Con este método de descubrimiento rápido de genes, el MPOB generó más de 17.000 EST para la palma de aceite. Los EST demostraron ser valiosos como fuente de marcadores moleculares, con aplicación potencial para el mejoramiento genético de la palma de aceite y el cultivo de tejidos. En el esfuerzo para asignar funciones a los genes descubiertos en la palma de aceite, se inició también un programa de microarreglos de ADN. El EST y otras secuencias clonadas del gen de la palma de aceite se imprimieron en microarreglos o chips de ADN, y se estudiaron sus posibles funciones en diversos tejidos y fases de desarrollo, especialmente durante el cultivo de tejidos de la palma de aceite. Para sobreponerse a las deficiencias asociadas con los EST, la MPOB también inició un proyecto para generar la primera colección completa de secuencias de genes de un cultivo oleaginoso mediante la secuenciación de las regiones hipometiladas del genoma de la palma de aceite, empleando la técnica de filtración de metilación GeneThresherTM. Más de 400.000 secuencias se generaron de nueve palmas individuales. También se minaron y se emplearon marcadores microsatelitales (repeticiones de secuencia simple, SSR, por su sigla en inglés) y polimorfismos de un solo nucleótido (SNP, por su sigla en inglés) para construir mapas genéticos de alta densidad de la palma de aceite. A fin de obtener una cobertura más completa del genoma, el MPOB emprendió la secuenciación del genoma y del transcriptoma de la palma de aceite mediante el empleo de tecnologías de secuenciación de próxima generación (NGS, por su sigla en inglés). Asimismo se continúa activamente con la investigación citogenética molecular para obtener un panorama completo de la estructura y organización del genoma de la palma de aceite.

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Biografía del autor

Rajinder Singh, Malaysian Palm Oil Board
Jefe de la Unidad de Genómica del Malaysian Palm Oil Board Malasia
Leslie Low Eng Ti, Institusi, Bandar Baru Bangi

Junta Malaya de Cultivadores de Palma de Aceite

Maria Madon, Institusi, Bandar Baru Bangi
Junta Malaya de Cultivadores de Palma de Aceite
Meilina Ong Abdullah, Institusi, Bandar Baru Bangi
Junta Malaya de Cultivadores de Palma de Aceite
Leslie Ooi Cheng- Li, Institusi, Bandar Baru Bangi
Junta Malaya de Cultivadores de Palma de Aceite
Chan Pek Lan, Institusi, Bandar Baru Bangi
Junta Malaya de Cultivadores de Palma de Aceite
Ravigadev Sambanthamurthi, Institusi, Bandar Baru Bangi
Junta Malaya de Cultivadores de Palma de Aceite
Cómo citar
Singh, R., Low Eng Ti, L., Madon, M., Ong Abdullah, M., Ooi Cheng- Li, L., Pek Lan, C., & Sambanthamurthi, R. (11). Descifrar la información del genoma de la palma de aceite. Revista Palmas, 34, 153-160. Recuperado a partir de https://publicaciones.fedepalma.org/index.php/palmas/article/view/10678
Sección
Módulo 1